实验中心制订了安全保障制度，细化安全管理各项规定。出台实验室管理、安全与环境保护、安全准入等管理制度，细化实验室危险废弃物、危险化学品等20余项安全管理细则，严格规范危险物（药）品的购买、使用、储存、防护、处置等各环节。重点关注实验室废弃物的分类收集、集中处置工作。明确规定实验室危险废弃物管理、废弃物处置流程、废弃物中转站和容器使用管理要求，制定统一的实验废弃物标签、处置登记本等日常工作规范。建立应急处理预案、责任追究办法及检查督导制度。实验中心的安全工作有完善的规章制度，专人负责，督促检查落实，每学期的开始和结束前，以及节假日进行全面的安全检查，消除安全隐患；每个实验室配有安全责任人，节假日安排专人值班；实验指导和值班教师都负有安全责任。实验中心安装有连通于学校公安处的安全防盗系统，对重要实验室进行监控；对有化学物质的实验室，都安装有通风厨。中心建立了安全奖惩制度，对大意疏忽行为即使未造成安全事故，也进行惩处，防患于未然。